Le Parrainage Coop est certifié par le Bureau central des œuvres de bienfaisance (Zewo) et peut donc utiliser le label de qualité Zewo, attribué aux organismes à but non lucratif qui respectent certaines exigences strictes.
Le Parrainage Coop pour les régions de montagne est membre du ZEWO et coordonne ses activités avec d'autres organisations d'entraide suisses. Il s'est vu octroyer le label de qualité du ZEWO dont il remplit les critères très sévères, lesquels concernent essentiellement le bon fonctionnement de structures de contrôle internes et externes, la transparence de la comptabilité, une information exhaustive des donateurs, une utilisation ciblée des dons et l'absence de harcèlement publicitaire.